교육과학연구소의 전신은 교육방법연구실이다.
주체75(1986)년 12월 대학직속으로 조직되였던 교육방법연구실은 주체104(2015)년 4월 교육학부에 소속되였다. 주체107(2018)년 9월 16명의 기구편제를 가진 교육과학연구소가 교육학부로부터 분리되여 독자적인 단위로 되였다.
교육과학연구소는 대학의 교육과학발전전략을 작성하고 당의 교육정책과 대학교육발전전략을 실현하는데서 제기되는 교육과학적문제들을 연구해결하는 과학연구단위, 전략관리부서이다.
교육과학연구소가 진행하고있는 사업은 다음과 같다.
대학의 교육수준과 내용을 다른 나라 대학들의 교육수준과 비교하고 과학적으로 분석평가하며 세계적수준으로 끌어올리기 위한 연구사업
새로운 교수방법을 창조하며 일반화하기 위한 연구사업
현대교육과학과 교육기술을 연구하고 실천에 구현하여 교육의 과학화, 정보화를 실현하며 교육의 질을 결정적으로 높이기 위한 사업
교원, 연구사들의 교육과학연구과제설정에 대한 심의 및 평가
각종 교육과학성과증서수여와 관련한 심의 및 평가